A Freguesia da Gafanha da Encarnação possui equipamentos educativos com valências desde o ensino pré-primário até ao terceiro ciclo do ensino básico. São geridos de forma integrada pelo Agrupamento de Escolas da Gafanha da Encarnação, com sede na EB 2/3 da Gafanha da Encarnação, que gere também os equipamentos escolares da freguesia vizinha da Gafanha do Carmo.